NTFS 파티션을 가지고 있다면 임의의 다른 사용자로부터 파일의 내용을 보호하기위해 암호화된 파일 시스템(EFS)를 사용할 수 있다. 이것은 도난의 염려가 있는 노트북이나 많은 중요한 정보를 저장하고 있는 컴퓨터의 경우 아주 유용하다.

암호화된 파일을 찾는 방법은 다음과 같이 세가지가 있다.

1. cipher 명령
   
   
2. 파일을 출력하는데 윈도우즈 탐색기가 사용하는 색상을 변경
   1. 시작/제어판/폴더 옵션을 클릭한다.
   2. 보기 탭을 클릭한다.
   3. 고급 설정의 파일 및 폴더에서 암호화되거나 압축된 NTFS 파일을 컬러로 표시를 체크한다.
   4. 확인을 클릭한다.
3. 윈도우즈 탐색기에 특성열 추가
   1. -E를 눌러 윈도우즈 탐색기를 기동한다.
   2. 보기/자세히 메뉴를 클릭한다.
   3. 보기/세부 내용 선택 메뉴를 클릭한다.
   4. 특성을 체크하고, 확인을 클릭한다.